Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPD3P62318 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms