Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VBP1P61758 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VBP1P61758 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VBP1P61758 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VBP1P61758 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms