Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ABCE1P61221 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCE1P61221 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms