Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms