Protein–RNA interactions for Protein: P60827

C1QTNF8, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF8P60827 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF8P60827 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C1QTNF8P60827 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF8P60827 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF8P60827 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF8P60827 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF8P60827 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF8P60827 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms