Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLDN2P57739 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms