Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIPK4P57078 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIPK4P57078 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms