Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK1P57059 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK1P57059 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK1P57059 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK1P57059 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK1P57059 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK1P57059 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK1P57059 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK1P57059 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK1P57059 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK1P57059 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK1P57059 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK1P57059 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK1P57059 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK1P57059 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK1P57059 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK1P57059 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK1P57059 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK1P57059 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK1P57059 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK1P57059 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK1P57059 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK1P57059 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK1P57059 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK1P57059 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK1P57059 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK1P57059 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK1P57059 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK1P57059 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK1P57059 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK1P57059 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK1P57059 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK1P57059 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK1P57059 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK1P57059 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK1P57059 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK1P57059 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK1P57059 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK1P57059 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK1P57059 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK1P57059 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK1P57059 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK1P57059 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK1P57059 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK1P57059 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK1P57059 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK1P57059 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK1P57059 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms