Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms