Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK4P51957 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEK4P51957 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK4P51957 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK4P51957 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK4P51957 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK4P51957 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK4P51957 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK4P51957 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK4P51957 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK4P51957 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK4P51957 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK4P51957 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEK4P51957 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEK4P51957 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEK4P51957 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEK4P51957 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEK4P51957 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEK4P51957 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEK4P51957 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEK4P51957 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK4P51957 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK4P51957 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK4P51957 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK4P51957 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK4P51957 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK4P51957 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK4P51957 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEK4P51957 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK4P51957 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK4P51957 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK4P51957 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK4P51957 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK4P51957 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK4P51957 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK4P51957 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK4P51957 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK4P51957 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEK4P51957 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEK4P51957 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms