Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LUMP51884 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LUMP51884 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LUMP51884 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LUMP51884 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LUMP51884 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LUMP51884 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LUMP51884 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LUMP51884 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms