Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CRIP1P50238 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CRIP1P50238 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CRIP1P50238 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms