Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VEGFBP49765 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VEGFBP49765 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms