Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNTBP49356 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNTBP49356 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNTBP49356 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNTBP49356 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNTBP49356 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTBP49356 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTBP49356 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTBP49356 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTBP49356 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTBP49356 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTBP49356 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTBP49356 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTBP49356 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTBP49356 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTBP49356 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTBP49356 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNTBP49356 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNTBP49356 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNTBP49356 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNTBP49356 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNTBP49356 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 534.9 ms