Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACADSBP45954 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACADSBP45954 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACADSBP45954 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ACADSBP45954 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACADSBP45954 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACADSBP45954 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACADSBP45954 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACADSBP45954 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACADSBP45954 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms