Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CAP42336 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms