Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTGDSP41222 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms