Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP8P40818 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP8P40818 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP8P40818 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP8P40818 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP8P40818 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP8P40818 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP8P40818 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP8P40818 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP8P40818 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP8P40818 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP8P40818 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP8P40818 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP8P40818 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP8P40818 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms