Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 CHZ1YER030W 462 nt1.63□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 GMC2YLR445W 567 nt1.63□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 SEC63YOR254C 1992 nt1.63□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 YDR042CYDR042C 603 nt1.62□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 BTT1YDR252W 450 nt1.62□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 AIM18YHR198C 966 nt1.62□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 YIL102CYIL102C 306 nt1.62□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 YIR020CYIR020C 303 nt1.62□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 TIM8YJR135W-A 264 nt1.62□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 SNC2YOR327C 348 nt1.62□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.62□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 ROX1YPR065W 1107 nt1.62□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 YOR019WYOR019W 2193 nt1.61□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 YDL068WYDL068W 330 nt1.61□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.61□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 SPO13YHR014W 876 nt1.61□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 RPB11YOL005C 363 nt1.61□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 YPR172WYPR172W 603 nt1.61□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 MSH6YDR097C 3729 nt1.61□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 CDC27YBL084C 2277 nt1.61□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 MUD2YKL074C 1584 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 NUP82YJL061W 2142 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 RKM1YPL208W 1752 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 ADR1YDR216W 3972 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 BUD19YJL188C 309 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 NCE101YJL205C 162 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 HSK3YKL138C-A 210 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 YLR252WYLR252W 306 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 SEN15YMR059W 387 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 SWS2YNL081C 432 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 CYB5YNL111C 363 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 RTC6YPL183W-A 282 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 SEY1YOR165W 2331 nt1.6□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 DOT6YER088C 2013 nt1.59□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 TIM10YHR005C-A 282 nt1.59□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 PFD1YJL179W 330 nt1.59□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 AFB1YLR040C 675 nt1.59□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 YLR271WYLR271W 825 nt1.59□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 YBR174CYBR174C 315 nt1.59□□□□□ -2.15
SHQ1P40486 MSH3YCR092C 3057 nt1.59□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 UTP13YLR222C 2454 nt1.58□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 GIC1YHR061C 945 nt1.58□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 SPC29YPL124W 762 nt1.58□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 SPO24YPR036W-A 204 nt1.58□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 MNL2YLR057W 2550 nt1.57□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 RPL31AYDL075W 342 nt1.57□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 HNT1YDL125C 477 nt1.57□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 RTR2YDR066C 591 nt1.57□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 YPL197CYPL197C 414 nt1.57□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 GPX2YBR244W 489 nt1.57□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 PLC1YPL268W 2610 nt1.57□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 CCH1YGR217W 6120 nt1.57□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 TBS1YBR150C 3285 nt1.57□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.56□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt1.56□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 YIL029CYIL029C 429 nt1.56□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 YKL111CYKL111C 336 nt1.56□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 GNT1YOR320C 1476 nt1.56□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 NOT5YPR072W 1683 nt1.55□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 YDR029WYDR029W 315 nt1.55□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 OCA6YDR067C 675 nt1.55□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 PRM8YGL053W 714 nt1.55□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 LSO2YGR169C-A 279 nt1.55□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt1.55□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt1.55□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 TRX1YLR043C 312 nt1.55□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 YMR324CYMR324C 243 nt1.55□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 YDL158CYDL158C 309 nt1.54□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.54□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 SPC1YJR010C-A 285 nt1.54□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 SEC22YLR268W 645 nt1.54□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 PGA1YNL158W 597 nt1.54□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 SGD1YLR336C 2700 nt1.54□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 SNF5YBR289W 2718 nt1.54□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 ZRG8YER033C 3231 nt1.53□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 COX7YMR256C 183 nt1.53□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 MDM20YOL076W 2391 nt1.53□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 PET127YOR017W 2403 nt1.53□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 NOP53YPL146C 1368 nt1.53□□□□□ -2.16
SHQ1P40486 YLR149CYLR149C 2193 nt1.52□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 KAR3YPR141C 2190 nt1.52□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.52□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 YNR025CYNR025C 360 nt1.52□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 SKI3YPR189W 4299 nt1.52□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 IRE1YHR079C 3348 nt1.51□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 DAS1YJL149W 1992 nt1.51□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.51□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 CMC2YBL059C-A 330 nt1.51□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 SXM1YDR395W 2835 nt1.51□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 KCS1YDR017C 3153 nt1.51□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 YDL016CYDL016C 303 nt1.5□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 snR84snR84 550 nt1.5□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 IES5YER092W 378 nt1.5□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 IRC19YLL033W 693 nt1.5□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 BER1YLR412W 825 nt1.5□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 UBX4YMR067C 1251 nt1.5□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 YBL083CYBL083C 426 nt1.5□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 YBR224WYBR224W 516 nt1.5□□□□□ -2.17
SHQ1P40486 COX1Q0045 1605 nt1.5□□□□□ -2.17
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