Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 SGD1YLR336C 2700 nt3.1□□□□□ -1.91
YAR028WP39548 TOF2YKR010C 2316 nt3.09□□□□□ -1.91
YAR028WP39548 COP1YDL145C 3606 nt3.09□□□□□ -1.91
YAR028WP39548 NAB3YPL190C 2409 nt3.09□□□□□ -1.91
YAR028WP39548 ALK2YBL009W 2031 nt3.09□□□□□ -1.91
YAR028WP39548 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt3.09□□□□□ -1.91
YAR028WP39548 RRT15YLR162W-A 189 nt3.09□□□□□ -1.91
YAR028WP39548 CIN8YEL061C 3003 nt3.09□□□□□ -1.91
YAR028WP39548 CSR2YPR030W 3366 nt3.09□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 MET5YJR137C 4329 nt3.08□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 FLO9YAL063C 3969 nt3.08□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.08□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 TRX1YLR043C 312 nt3.08□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 FPR1YNL135C 345 nt3.08□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 BCH1YMR237W 2175 nt3.08□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 BAS1YKR099W 2436 nt3.08□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 RIX1YHR197W 2292 nt3.07□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 ARO1YDR127W 4767 nt3.07□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 YDL242WYDL242W 354 nt3.07□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 RGM1YMR182C 636 nt3.07□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 ORC1YML065W 2745 nt3.07□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 TMN3YER113C 2121 nt3.07□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 STT4YLR305C 5703 nt3.06□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 STE23YLR389C 3084 nt3.06□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 ERP6YGL002W 651 nt3.06□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 YML037CYML037C 1023 nt3.06□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 YHR080CYHR080C 4038 nt3.06□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 PHO2YDL106C 1680 nt3.05□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 PDE2YOR360C 1581 nt3.05□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 VPS35YJL154C 2835 nt3.05□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 YGR164WYGR164W 336 nt3.05□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 YOR333CYOR333C 417 nt3.05□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt3.05□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 YBR224WYBR224W 516 nt3.05□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 MRP10YDL045W-A 288 nt3.04□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 snR76snR76 109 nt3.04□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 SSS1YDR086C 243 nt3.04□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 VMA9YCL005W-A 222 nt3.04□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 YAK1YJL141C 2424 nt3.04□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 CDC27YBL084C 2277 nt3.04□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 PSY2YNL201C 2577 nt3.03□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 INA22YIR024C 651 nt3.03□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 PFK26YIL107C 2484 nt3.03□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 CHS2YBR038W 2892 nt3.03□□□□□ -1.92
YAR028WP39548 HSC82YMR186W 2118 nt3.02□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 SMD1YGR074W 441 nt3.02□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 YBL083CYBL083C 426 nt3.02□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 TAF2YCR042C 4224 nt3.02□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 PEX8YGR077C 1770 nt3.02□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 PTC5YOR090C 1719 nt3.02□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 YDR286CYDR286C 345 nt3.01□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt3.01□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 YOR376WYOR376W 369 nt3.01□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 CHO2YGR157W 2610 nt3□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 ENA5YDR038C 3276 nt3□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 ENA2YDR039C 3276 nt3□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 ENA1YDR040C 3276 nt3□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 UBP11YKR098C 2154 nt3□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 SNC2YOR327C 348 nt3□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt3□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 snR48snR48 113 nt3□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 CFT2YLR115W 2580 nt3□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 SPO14YKR031C 5052 nt2.99□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 DRS2YAL026C 4068 nt2.99□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 AI2Q0055 2565 nt2.99□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.99□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 RPS28BYLR264W 204 nt2.99□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 YPR092WYPR092W 306 nt2.99□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 PLC1YPL268W 2610 nt2.99□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 EFR3YMR212C 2349 nt2.98□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 YMR317WYMR317W 3423 nt2.98□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 SEC5YDR166C 2916 nt2.98□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 YGL217CYGL217C 342 nt2.98□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 COF1YLL050C 432 nt2.98□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 VPS54YDR027C 2670 nt2.98□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 DNL4YOR005C 2835 nt2.98□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 NOP53YPL146C 1368 nt2.98□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 KSP1YHR082C 3090 nt2.97□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 snR46snR46 197 nt2.97□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 ROG1YGL144C 2058 nt2.97□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 SPT21YMR179W 2277 nt2.96□□□□□ -1.93
YAR028WP39548 DSE4YNR067C 3354 nt2.96□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 RPN1YHR027C 2982 nt2.96□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 VAS1YGR094W 3315 nt2.96□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 YPR089WYPR089W 2667 nt2.96□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 HRD3YLR207W 2502 nt2.95□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 VPH1YOR270C 2523 nt2.95□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.95□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 YTA7YGR270W 4140 nt2.95□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 PRP8YHR165C 7242 nt2.95□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 LRE1YCL051W 1752 nt2.95□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 BUD4YJR092W 4344 nt2.95□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 SSQ1YLR369W 1974 nt2.94□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 PRP6YBR055C 2700 nt2.94□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.94□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 VPS34YLR240W 2628 nt2.93□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 SEF1YBL066C 3447 nt2.93□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 SLH1YGR271W 5904 nt2.93□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 YLR149CYLR149C 2193 nt2.93□□□□□ -1.94
YAR028WP39548 snR74snR74 88 nt2.93□□□□□ -1.94
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