Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIK1P39086 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIK1P39086 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms