Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITGAEP38570 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITGAEP38570 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms