Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6V1E1P36543 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms