Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BRS3P32247 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BRS3P32247 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BRS3P32247 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRS3P32247 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRS3P32247 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRS3P32247 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRS3P32247 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRS3P32247 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BRS3P32247 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BRS3P32247 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRS3P32247 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRS3P32247 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BRS3P32247 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms