Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCKARP32238 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCKARP32238 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKARP32238 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCKARP32238 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCKARP32238 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKARP32238 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCKARP32238 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms