Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXA13P31271 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms