Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA10P31260 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA10P31260 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms