Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms