Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP1P29466 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP1P29466 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP1P29466 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP1P29466 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP1P29466 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP1P29466 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP1P29466 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP1P29466 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP1P29466 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP1P29466 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP1P29466 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP1P29466 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP1P29466 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP1P29466 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP1P29466 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP1P29466 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP1P29466 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP1P29466 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP1P29466 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP1P29466 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP1P29466 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP1P29466 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP1P29466 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms