Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2E2P29084 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2E2P29084 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms