Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SSFA2P28290 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SSFA2P28290 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms