Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRDP23468 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRDP23468 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRDP23468 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRDP23468 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRDP23468 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRDP23468 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTPRDP23468 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTPRDP23468 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRDP23468 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRDP23468 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRDP23468 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRDP23468 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRDP23468 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRDP23468 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRDP23468 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRDP23468 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRDP23468 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRDP23468 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRDP23468 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRDP23468 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRDP23468 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRDP23468 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRDP23468 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRDP23468 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRDP23468 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRDP23468 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRDP23468 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRDP23468 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRDP23468 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRDP23468 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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