Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
C4BPBP20851 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BPBP20851 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms