Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB1P20618 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PSMB1P20618 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms