Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT15P19012 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT15P19012 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KRT15P19012 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRT15P19012 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT15P19012 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT15P19012 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT15P19012 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT15P19012 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT15P19012 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT15P19012 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT15P19012 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT15P19012 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT15P19012 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT15P19012 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT15P19012 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRT15P19012 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT15P19012 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT15P19012 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRT15P19012 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRT15P19012 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT15P19012 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT15P19012 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms