Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARF4P18085 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARF4P18085 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARF4P18085 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARF4P18085 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARF4P18085 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARF4P18085 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARF4P18085 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARF4P18085 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARF4P18085 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARF4P18085 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF4P18085 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARF4P18085 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms