Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DESP17661 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DESP17661 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DESP17661 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DESP17661 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DESP17661 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DESP17661 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DESP17661 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DESP17661 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DESP17661 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DESP17661 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DESP17661 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms