Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB1P16220 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CREB1P16220 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CREB1P16220 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB1P16220 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB1P16220 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB1P16220 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB1P16220 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB1P16220 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB1P16220 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB1P16220 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB1P16220 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB1P16220 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB1P16220 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB1P16220 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB1P16220 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CREB1P16220 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREB1P16220 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREB1P16220 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREB1P16220 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREB1P16220 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREB1P16220 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREB1P16220 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CREB1P16220 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CREB1P16220 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CREB1P16220 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CREB1P16220 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms