Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPA1P15085 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPA1P15085 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA1P15085 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA1P15085 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA1P15085 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA1P15085 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA1P15085 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA1P15085 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA1P15085 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA1P15085 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA1P15085 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPA1P15085 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPA1P15085 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPA1P15085 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPA1P15085 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPA1P15085 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPA1P15085 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPA1P15085 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA1P15085 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA1P15085 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA1P15085 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA1P15085 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA1P15085 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA1P15085 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPA1P15085 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms