Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXD8P13378 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXD8P13378 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms