Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GP1BBP13224 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GP1BBP13224 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms