Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VPREB1P12018 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
VPREB1P12018 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms