Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3P10147 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3P10147 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3P10147 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3P10147 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3P10147 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3P10147 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3P10147 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3P10147 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3P10147 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3P10147 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3P10147 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3P10147 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3P10147 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3P10147 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3P10147 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL3P10147 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL3P10147 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL3P10147 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCL3P10147 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3P10147 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3P10147 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms