Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TMEM225BP0DP42 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM225BP0DP42 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms