Protein–RNA interactions for Protein: P0C7X2

ZNF688, Zinc finger protein 688, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF688P0C7X2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF688P0C7X2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms