Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C4AP0C0L4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C4AP0C0L4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms