Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PARP1P09874 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PARP1P09874 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PARP1P09874 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PARP1P09874 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PARP1P09874 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PARP1P09874 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP1P09874 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP1P09874 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP1P09874 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP1P09874 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP1P09874 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PARP1P09874 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms