Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKHD1P08F94 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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