Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDHBP07195 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDHBP07195 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LDHBP07195 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LDHBP07195 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDHBP07195 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDHBP07195 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDHBP07195 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDHBP07195 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDHBP07195 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDHBP07195 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDHBP07195 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDHBP07195 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDHBP07195 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDHBP07195 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDHBP07195 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDHBP07195 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDHBP07195 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDHBP07195 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDHBP07195 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDHBP07195 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LDHBP07195 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms