Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TYMSP04818 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TYMSP04818 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TYMSP04818 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TYMSP04818 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TYMSP04818 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TYMSP04818 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TYMSP04818 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TYMSP04818 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms